Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms