Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim7Q3TJD7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms