Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc2Q3SXD3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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