Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms