Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col24a1Q30D77 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms