Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Specc1lQ2KN98 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms