Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lingo4Q149C3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lingo4Q149C3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms