Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms