Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms