Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms