Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MitfQ08874 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms