Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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