Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnn1Q08091 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnn1Q08091 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnn1Q08091 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnn1Q08091 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn1Q08091 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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