Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a2Q07643 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms