Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms