Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms