Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms