Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms