Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms