Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms