Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1Q04750 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms