Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelaQ04207 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelaQ04207 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms