Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Crisp3Q03402 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms