Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms