Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb5Q02739 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms