Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnb1Q02248 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnb1Q02248 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms