Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms