Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms