Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RykQ01887 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RykQ01887 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RykQ01887 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RykQ01887 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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