Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd1Q01822 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms