Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms