Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms