Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms