Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms