Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms