Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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