Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms