Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sparcl1P70663 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms