Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad1P70340 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms