Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms