Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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