Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tra2bP62996 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms