Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms