Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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