Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms