Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2iP60898 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms