Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms