Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms