Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpa1P57784 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpa1P57784 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms