Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms